Κάποτε ήταν ένα από τα μεγαλύτερα αστέρια της παγκόσμιας κολύμβησης. Ένας τραυματισμός στον ώμο και ένα χειρουργείο, στέρησαν από τον Τζέις Μάγκνουσεν την ταχύτητα και ο ίδιος αποφάσισε το 2017 να μην αγωνιστεί καθόλου για να αποκαταστήσει τον ώμο του.
Παγκόσμιος πρωταθλητής το 2011 και το 2013 στα 100μ. ελεύθερο, αλλά αργυρός Ολυμπιονίκης το 2012 στο Λονδίνο (μόλις 0.01 πίσω από τον Νέιθαν Έιντριαν), ο Μάγκνουσεν ήταν ο σούπερ σταρ τον Αυστραλών μέχρι που το 2014 τραυματίστηκε και αναγκάστηκε να μείνει εκτός όλο το 2015 χάνοντας το παγκόσμιο πρωτάθλημα του Καζάν και μαζί και τον τίτλο του. Το 2016 επέστρεψε όμως δεν ήταν το ίδιο γρήγορος με πριν. Το 2012 έκανε 47.10 απειλώντας το παγκόσμιο ρεκόρ του Σέζαρ Σιέλο (46.91) και το 2016 48.49 για να μείνει ταξιδέψει στο Ρίο για τους Ολυμπιακούς, μόνο για τη σκυτάλη.
Ο 25χρονος επέστρεψε από τη Βραζιλία έχοντας το χάλκινο μετάλλιο στα 4Χ100μ. ελεύθερο, όμως αυτό δεν είναι αρκετό για τον Μάγκνουσεν ο οποίος έχει μπροστά του πλέον τον 18χρονο χρυσό Ολυμπιονίκη στα 100μ. Κάιλ Τσάλμερς αλλά και τον 22χρονο Κάμερον Μάκιβοϊ ο οποίος φέτος κολύμπησε το κατοστάρι σε 47.04 που είναι ο καλύτερος χρόνος όλων των εποχών με συμβατικό μαγιό (ο Σιέλο έκανε το παγκόσμιο ρεκόρ με συνθετικό μαγιό).
Για το λόγο αυτό, επέλεξε να χάσει ακόμα ένα παγκόσμιο πρωτάθλημα για να επιστρέψει υγιής και έχοντας ξεπερασει πλήρως τον τραυματισμό στον αριστερό ώμο, το 2018. Τότε που έχει μόνο αγώνες κοινοποιτείας για τους Αυστραλούς.
